Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK3Q16288 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
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