Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC6Q16204 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms