Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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