Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS72Q15906 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
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