Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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