Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP4Q15650 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP4Q15650 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms