Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKIV2LQ15477 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms