Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBM39Q14498 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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RBM39Q14498 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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RBM39Q14498 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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RBM39Q14498 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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RBM39Q14498 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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RBM39Q14498 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM39Q14498 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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