Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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