Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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