Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKD2Q13563 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKD2Q13563 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
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