Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAMK2BQ13554 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAMK2BQ13554 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms