Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IKZF1Q13422 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IKZF1Q13422 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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