Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR1H3Q13133 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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NR1H3Q13133 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1H3Q13133 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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