Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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