Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN3Q13064 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
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