Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDC16Q13042 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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