Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COX10Q12887 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX10Q12887 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX10Q12887 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX10Q12887 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX10Q12887 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms