Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TROQ12816 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TROQ12816 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TROQ12816 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TROQ12816 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TROQ12816 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TROQ12816 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TROQ12816 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
TROQ12816 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TROQ12816 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TROQ12816 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TROQ12816 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TROQ12816 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TROQ12816 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TROQ12816 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
TROQ12816 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TROQ12816 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TROQ12816 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TROQ12816 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TROQ12816 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TROQ12816 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms