Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWF1Q12792 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWF1Q12792 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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