Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms