Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAMSAP2Q08AD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAMSAP2Q08AD1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms