Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PUDPQ08623 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms