Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBQ06643 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBQ06643 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBQ06643 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms