Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PSME1Q06323 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSME1Q06323 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms