Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALD1Q05682 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms