Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN1Q05586 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms