Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2BQ02880 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms