Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL6Q02878 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms