Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms