Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2F1Q01094 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F1Q01094 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms