Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms