Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3AP98173 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms