Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RBP5P82980 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBP5P82980 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBP5P82980 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBP5P82980 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBP5P82980 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBP5P82980 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms