Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBG1P69891 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBG1P69891 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBG1P69891 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBG1P69891 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBG1P69891 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBG1P69891 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBG1P69891 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBG1P69891 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBG1P69891 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBG1P69891 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBG1P69891 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBG1P69891 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBG1P69891 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBG1P69891 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBG1P69891 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBG1P69891 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBG1P69891 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBG1P69891 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms