Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2L3P68036 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2L3P68036 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms