Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL23P62829 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL23P62829 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL23P62829 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL23P62829 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL23P62829 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL23P62829 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms