Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOBP62745 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms