Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FCGRTP55899 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FCGRTP55899 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms