Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELLP55199 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELLP55199 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ELLP55199 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ELLP55199 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms