Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB3P54284 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNB3P54284 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms