Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M2P53677 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP3M2P53677 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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