Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA2P51531 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SMARCA2P51531 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC35.7■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SMARCA2P51531 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms