Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK7P50613 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK7P50613 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK7P50613 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK7P50613 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK7P50613 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK7P50613 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK7P50613 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK7P50613 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms