Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LHX2P50458 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX2P50458 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX2P50458 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms