Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK2P49760 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLK2P49760 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLK2P49760 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK2P49760 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK2P49760 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK2P49760 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK2P49760 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK2P49760 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK2P49760 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK2P49760 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms