Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN1S1P47710 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms