Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
LRPPRCP42704 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRPPRCP42704 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms