Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms