Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGFBR1P36897 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms